北京中醫(yī)藥大學(xué)東方醫(yī)院建立于1986年，于1999年12月12日正式營(yíng)業(yè)，是北京中醫(yī)藥大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院，地方中醫(yī)藥管理局直管機(jī)構(gòu)，地方中醫(yī)臨床研究建設(shè)單位，是一所特色顯著、功能完善、機(jī)器設(shè)備先進(jìn)，集診療、教學(xué)、科學(xué)研究、防治和健康咨詢?yōu)橐惑w的三級(jí)甲等中醫(yī)醫(yī)院，是國(guó)家教育部211工程建設(shè)的中醫(yī)藥大學(xué)附院，北京醫(yī)保定點(diǎn)醫(yī)療機(jī)構(gòu)。

　　2011年6月，北京中醫(yī)藥大學(xué)東方醫(yī)院正式接收北京市二七機(jī)車廠醫(yī)院，改名為北京中醫(yī)藥大學(xué)東方醫(yī)院西院區(qū)(二七分院)。2015年5月25日東方醫(yī)院正式簽約大興區(qū)南院區(qū)，改名為北京中醫(yī)藥大學(xué)東方醫(yī)院南院區(qū)。北京中醫(yī)藥大學(xué)東方醫(yī)院現(xiàn)為一院三區(qū)：即東方醫(yī)院方莊院區(qū)、東方醫(yī)院二七分院(二七院區(qū))、東方醫(yī)院南院區(qū)。北京中醫(yī)藥大學(xué)東方醫(yī)院總占地面積5.68萬平方，建筑面積12.45萬平方。