北京中醫(yī)藥大學東直門醫(yī)院建立于1958年，是一所集診療、教學、科學研究為一體的大型綜合中醫(yī)醫(yī)院。是全國僅有的一所進到地方“211工程”建設的高等中醫(yī)藥學校——北京中醫(yī)藥大學的第一臨床醫(yī)學院，并率先成為全國示范性中醫(yī)院、三級甲等中醫(yī)醫(yī)院、地方中醫(yī)臨床研究基地建設單位（三個重點病種：腦中風、老年性癡呆病、糖尿病腎病）和地方食品類藥監(jiān)局評定的地方藥品臨床試驗組織 。北京中醫(yī)藥大學東直門醫(yī)院還是北京醫(yī)保定點醫(yī)療機構，國家民政部“明天計劃”腦癱患兒手術康復和“點燃心希望”先心病醫(yī)治定點醫(yī)療機構。

　　二零一零年，北京中醫(yī)藥大學東直門醫(yī)院被確立為“地方中醫(yī)藥學發(fā)展綜合改革試點區(qū)”建設示范基地和戰(zhàn)略合作簽約企業(yè)。二零一一年8月6日，原通州區(qū)中醫(yī)院與本院整合，并取名為北京中醫(yī)藥大學東直門醫(yī)院東區(qū)。醫(yī)院開創(chuàng)性地于1991年較早在歐州創(chuàng)建了分院——德國魁茨汀醫(yī)院，做為重要的中醫(yī)藥國際交流窗口，載入中德外交史冊。在世界各國享有盛名和獲得眾多消費者的一致好評。