目前，清華大學附屬北京清華長庚醫院是由清華大學和北京共同建設和管理的大型綜合性公立醫院。在建設過程中，得到了臺灣塑料企業和臺灣長庚紀念醫院的無私捐贈和援助。目前，醫院位于北京市昌平區天通苑地區，總規劃床位1500張。現于2014年11月28日開業，一期1000張床位，2015年11月正式為醫療保險患者服務；2017年6月，異地醫療保險直接結算。

   目前，北京清華長庚醫院借鑒臺灣長庚紀念醫院的領先經驗，建立了現代醫院管理體系和運營模式，建立了專家委員會體系，發展了專業的行政管理團隊，不斷優化組織結構和運營效率，形成了標準化、科學、精益完善的治理體系。

   目前，北京清華長庚醫院是集醫療、教學、科研、預防、康復為一體的清華大學附屬醫院，臨床專業設置齊全。醫院自開業以來，堅持綜合、專業的發展戰略，形成了肝膽胰腺中心、神經中心、消化中心、急重癥中心綜合醫療中心，出現了心臟病、婦產科、耳鼻喉科頭頸外科、泌尿科、骨科、放射科、麻醉等重點專業，目前整體醫療服務能力已達到國內一流水平。醫院已被批準為國家住院醫師標準化培訓基地和國家專業醫師標準化培訓試點基地，現已獲得器官移植資格和國家藥物臨床試驗機構資格，以及醫療器械臨床試驗機構資格。