北京中醫藥大學東方醫院成立于1986年，1999年12月12日正式開業，是北京中醫藥大學第二臨床醫學院、國家中醫藥管理局直接管理單位、國家中醫臨床研究基地建設單位，是一家特色明顯、功能齊全、設備先進、醫療、教學、科研、預防、健康咨詢三級中醫醫院，是教育部直接管理的，進入北京中醫藥大學附屬醫院的國家211項目，北京醫療保險指定醫院。2011年6月，北京中醫藥大學東方醫院正式接收了北京27機車廠醫院，命名為北京中醫藥大學東方醫院西醫院（27醫院）。2015年5月25日，東方醫院正式簽署了大興南醫院區，命名為北京中醫藥大學東方醫院南醫院區（經濟開發區）。醫院現為三個醫院區：東方醫院、東方醫院西醫院區、東方醫院南醫院區（27醫院）。總占地面積（經濟開發區）。5.68總建筑面積萬平方米12.43萬平方米。