上海交通大學醫學院附屬新華醫院口腔科始建于50年代末，是一個集醫療、教學、科研于一體的以口腔黏膜病、口腔正畸等亞專科為特色的綜合性口腔醫學學科，是上海市口腔醫學會常務理事成員單位、國家口腔臨床重點專科核心單位;科室診療設備先進、治療項目齊全，并具有良好的醫療傳統和口腔醫療、科研和教學經驗。現由吳建勇主任醫師擔任科主任，科室現有口腔執業醫師29名(其中博士學位6名，碩士學位12名;主任醫師1名、副主任醫師8名)，技師3名，護師、護士12名。

   擁有口腔外科、口腔內科、口腔粘膜病、口腔修復、口腔正畸、口腔種植、兒童口腔等亞專業，并開展相應的專業診斷、治療和教學研究。該部門還開設了兒童口腔齲齒診所，為患有齲齒的兒童提前發現和治療，并積極進行口腔衛生教育，以更好地預防齲齒的發生。