南通大學附屬醫院成立于1911年，是江蘇省衛生計生委指定的蘇中地區醫療技術指導中心術指導中心。1994年被衛生部評為三級甲級綜合醫院，1998年被確定為國際應急救援中心網絡醫院。醫院實際開放床位2035張，占地面積9.1建筑面積1萬平方米，18.7萬平方米。2017年總診療人數為200萬，出院患者10.1一萬人次，同時住院手術4.4萬臺。現有員工3000余人，其中高級職稱270余人，國務院專項津貼專家25人，博士生、碩士導師300余人。

   醫院新領導班子任職以來，建立了以醫療為中心、科技創新、人才培養為兩翼的一體兩翼、強體健翼發展戰略，緊跟醫療衛生體制改革形勢。同時，以綜合目標管理責任制考核指標為出發點，扎實推進醫療服務品牌建設項目，堅持公立醫院辦院方向，認真落實發展任務，不斷加強基礎管理，統籌推進學科建設、人才培養和技術進步，醫療質量和安全不斷提高。現在科教興院成效顯著，黨建廉政行風建設扎實有效，醫院文化特色鮮明。

   臨床醫學是江蘇省重點學科和博士學位授權一級學科，ESI排名躋身全球前1%，且排名不斷前移。現在醫院手外科為江蘇省臨床醫學研究中心;而且神經疾病診療中心為江蘇省“科教強衛工程”十大和“臨床醫學中心”之一，而且有手外科、醫學檢驗科、血液科、眼科為省“科教強衛工程”的醫學重點學科;普外科、骨科、眼科、消化內科、和血液內科、醫學檢驗科、心血管內科、神經內科、和皮膚科、腎臟內科、呼吸內科、和婦產科、神經外科、急診醫學科、和醫學影像科、耳鼻咽喉科、和心胸外科、腫瘤科、整形外科、和重癥醫學科、風濕免疫科、康復科、和兒科、病理科等24個專科為省級臨床重點專科。而且醫院首批通過國家衛計委干細胞臨床研究機構認證，現在是國家高級卒中中心、和中國胸痛中心、心衰中心、房顫中心、和國家腦防委心源性卒中防治基地建設單位、和江蘇省孕產婦危急重癥救治指導中心和江蘇省創傷救治中心。而且醫院先后建成國家級博士后科研工作站、和博士后科研流動站。同時擁有省“333工程”人才38人;而且省特聘醫學專家3人;省“科教強衛工程”醫學創新團隊2個，同時，醫學重點人才2人；省六大人才高峰項目資助80人。現任中華醫學會專業分會、專業組委員及以上職務32人（其中骨科分會副主任1人）、省醫學會專業分會副主任32人（其中主任1人、候選人5人），省口腔醫學會專業分會主任1人。

   南通市老年康復醫院(南通大學附屬醫院分院)成立于1994年7月，是一家集康復醫學、老年醫學、慢性病治療為特色的二級甲等綜合醫院，是自收自支的事業單位。目前開放床位477張，現有員工557人，其中副高級以上專業技術人員124人，中級專業技術人員145人。內外各科資深專家教授38人，專業醫護人員隊伍水平較高。目前，醫院口腔科可成功開展以下治療項目:簡單牙、復雜牙、阻生牙拔除、口腔頜面部創傷清創縫合、口腔頜面部腫瘤診治；補牙(一次性填充、根管治療)、口腔黏膜病診治、牙周病診治、兒童牙病(補牙、窩溝封閉)；鑲牙(活動支撐牙、瓷牙、固定橋、全口假牙)、矯正牙(地包天、青少年、成人牙列感染的可能性從根本上消毒。我院口腔門診可以實現一次性消毒，檢查器械一次性消毒。