新疆醫科大學第五附屬醫院口腔科成立于20世紀40年代，經過70多年的發展，形成了口腔正畸治療、醫學、教學、研究，是自治區臨床重點專業的強大技術實力，不僅是新疆醫科大學教育先鋒，也是國家口腔住院醫師標準化培訓基地。口腔科總面積約1800平方米，不僅有35個綜合治療平臺，還有先進的數字成像系統，CBCT、口腔種植系統，Leica根管顯微鏡、根管治療機擴展等。亞專業包括牙髓病、正畸和牙周粘膜、兒童牙科疾病、口腔修復、牙槽外科、口腔頜面外科、口腔種植等。各種常見的口腔疾病和多種疾病的診斷和治療在該地區的同一行業中處于較高的水平。綜合治療能力相對較強。