南昌大學第二附屬醫院是江西省第一個開展牙科疾病防治的科室。由于業務的擴大，口腔科于1954年開展，并設立了住院病房。醫生們一直保持著謙虛的態度，不斷突破和創新口腔診斷和治療的重大問題，成功地促進了江西醫學會口腔科委員會的成立，在歷史發展中留下了豐富多彩的色彩。經過半個世紀的發展，口腔科現在擁有許多高級專業技術人員，包括口腔頜面整形外科、正畸等口腔亞專業。

   20世紀90年代，口腔科開展的新技術填補了全省20多個空白，并進行了帶蒂皮瓣和血管游離皮瓣顯微外科的重建和修復。同時，全省首次開展了牙周病序列治療和牙周引導組織再生術。

   口腔科成立于1946年，是江西省最早的牙科預防和治療部門。經過60多年的發展，醫療、教學和科學研究取得了巨大的進多年來開展的新技術填補了全省20多個空白。目前是全省三級甲等綜合醫院的口腔科。口腔科注重引進和消化國內外最新的診斷和治療方法，治療技術符合國際標準。專業治療方向有五個特點：頜頸部良惡性腫瘤手術及立即整復；頜面部創傷功能整復；嚴重阻塞性睡眠呼吸暫停低通風綜合征(osahs,即打鼾）手術治療；牙周病綜合序列治療；牙髓病無痛治療；種植義齒修復、鈦合金鑄造和各種精密附著體的生產。口腔科：主要治療齲齒、牙髓病、牙根疾病、牙發育不良、牙周炎、口腔粘膜疾病等口腔粘膜疾病。口腔頜面外科：主要治療炎癥、創傷、腫瘤、畸形、神經疾病、顳下頜關節疾病、唾液腺疾病等。如拔牙、種植牙、牙槽手術、唇裂、腭裂修復和頜畸形矯正、頜骨骨折、頜頸良惡性腫瘤、血管瘤和面部整形手術。口腔修復正畸科：主要治療牙列缺損、牙列缺失，殘根殘冠保存治療、前牙美容修復、牙齒嚴重磨損咬合重建、頜面部缺損修復。多系列固定器械和活動器械糾正青少年牙列不均勻或牙頜畸形。口腔科擁有10把高檔進口牙科綜合治療椅，進口一人一機消毒系統，全景數字成像X線機、牙科X片機、口腔種植機等先進設備。醫院有先進的CT頜骨三維重建,MRI及DSA等等，對口腔疾病的診斷很有幫助。