目前，安徽醫科大學第二附屬醫院是集醫療、教學、科研、預防、保健、康復等多功能于一體的大型現代綜合性三級醫院，位于國家合肥經濟技術開發區，現占地190畝，建筑面積約15萬畝m2，同時，2008年10月18日正式開業，設施先進，醫院環境優雅。醫院人才技術實力雄厚，員工1500余人，其中高級職稱175人，博士生導師11人，碩士生導師68人，安徽省相關學術團體主席、副主席20余人。自醫院開業以來，醫院承擔了260多個縱向科研項目，其中國家22個，省部238個；發表論文1500多篇，中國系列雜志77篇，現在SCI論文131篇；成立了20個教研室，多次成功舉辦國家和省級繼續教育項目。

   目前，醫院遵循仁愛、濟世、良醫、康民的宗旨，密切關注醫療質量和安全，注重醫學、教學、研究的全面協調發展。醫院設有42個科室，開放床位1300多張。并擁有省重點臨床專業（腫瘤科），目前三省重點培養專業（血液科、呼吸科、兒科）、四校重點學科（腎內科、麻醉科、普通外科、腫瘤科）、六校研究中心（醫學影像、心血管疾病、微創干預、血管外科、血液病、腦血管疾病），多個診療項目達到省先進水平，部分專業技術項目達到國內先進水平。

   目前，醫院不斷深化改革，創新醫院管理體系和管理模式，牢固樹立以人為本的科學發展服務理念，堅持病人第一，病人第一。高質量高效的服務已成為醫院發展的特點和亮點，贏得了患者和社會的廣泛認可，醫院知名度和聲譽顯著提高，在安徽省取得了許多第一和許多新的管理突破：現率先引入物流傳輸系統、靜脈輸液配置系統，開放全天候醫療技術檢查，實施全面的社會化管理；卡、排隊、電子處方、支付寶錢包，現在信息化處于省級先進水平。